izr. prof. dr. Tomaž Curk
Izredni profesor
Prodekan za raziskovalno dejavnost
Prodekan za raziskovalno dejavnost
T:
+386 1 479 8229
Govorilne ure:
Sreda ob 15:00, 3. nadstropje, soba R3.15 ali po Zoom.
Prostor:
R3.15 - Kabinet
Opis
Na FRI predavam bioinformatiko in strojno učenje. Raziskovalno se ukvarjam predvsem z bioinformatiko, kjer je uporaba metod strojnega učenja ključna za uspešno obvladovanje in odkrivanje znanj iz obsežnih bioloških zbirk podatkov.
Predmeti
- Uvod v bioinformatiko
- Veščine v znanstvenem delu 1
- Veščine v znanstvenem delu II
- Seminar 1
- Seminar 2
- Seminar 3
- Seminar 4
- Seminar 5
- Podatkovno rudarjenje
- Izbrana poglavja iz razvoja programske opreme 1
- Raziskovalno delo 1
- Raziskovalno delo 2
- Izbrana poglavja iz računalniških sistemov 1
- Uvod v podatkovne vede
- Raziskovalno delo 3
- Izbrana poglavja iz računalniških sistemov 1
- Izbrana poglavja iz razvoja programske opreme 1
- Izbrana poglavja iz računalništva in informatike
- Bioinformacijski algoritmi
Laboratorij
Projekti
-
JRC CDP - Skupni raziskovalni center Evropske komisije - sodelovanje pri doktorskem študiju
(JRC CDP), 22.06.2018 - 21.06.2023 -
L7-2632 - Nanopore visokozmogljivo sekvenciranje mikrobnih genomov za razrešitev epidemioloških in diagnostičnih vprašanj v rastlinski patologiji
Raziskovalni projekti ARRS(L7-2632), 01.09.2020 - 31.08.2023 -
J3-3065 - Ciljanje faznega ločevanja in agregacije proteinov v nevrodegenerativnih proteinopatijah TDP-43
Raziskovalni projekti ARRS(J3-3065), 01.10.2021 - 30.09.2024 -
L4-3179 - Odkrivanje in z vodo povezana epidemiologija porajajočih se tobamovirusov, ki okužujejo kmetijske rastline
Raziskovalni projekti ARRS(L4-3179), 01.10.2021 - 30.09.2024
Zaključeni projekti
-
Umetna inteligenca in inteligentni sistemi
Raziskovalni programi ARRS01.01.2015 - 31.12.2020 -
Tehnologije znanj za odkrivanje novih zdravilnih učinkovin: analiza in načrtovanje eksperimentov v visoko zmogljivostni genetiki
Raziskovalni projekti ARRS01.02.2008 - 31.01.2011 -
Metode za povezovanje podatkov in znanja v sistemski biologiji mrež
Raziskovalni projekti ARRS01.05.2009 - 30.04.2012 -
Modeliranje transkriptoma
Raziskovalni projekti ARRS01.05.2010 - 30.04.2012 -
Kompromisi obrambe in razvoja v večtrofični interakciji med krompirjem in dvema glavnima škodljivcema
Raziskovalni projekti ARRS01.07.2011 - 30.06.2014 -
Funkcijska genomika interakcije med krompirjem in PVY
Raziskovalni projekti ARRS01.07.2011 - 30.06.2014 -
Uporaba kombinacije tehnike naslednje generacije določevanja nukleotidnih zaporedij in metagenomske analize v diagnostiki pojava hmeljeve zakrnelosti
Raziskovalni projekti ARRS01.07.2011 - 30.06.2014 -
Premagovanje prekletstva dimenzionalnosti z uporabo predznanja
Raziskovalni projekti ARRS01.08.2013 - 31.07.2016 -
Post-transkripcijske regulacijske mreže v nevdrodegenerativnih boleznih
Raziskovalni projekti ARRS01.08.2013 - 31.07.2016 -
Analitična orodja nove generacije za integrirano analizo podatkov v sodobni genomiki
Bilaterarni projekti01.01.2011 - 31.12.2012 -
Računski pristopi za odkrivanje mehanizmov baterijske rezistence v Dictyosteliumu
Bilaterarni projekti01.01.2013 - 31.12.2014 -
Zlivanje podatkov v sistemski biologiji socialne amebe Dictyostelium
Bilaterarni projekti01.01.2015 - 31.12.2016 -
CLIP - Mapping functional protein-RNA interactions to identify new targets for oligonucleotide-based therapy
Evropski projekti(CLIP ), 01.04.2010 - 31.08.2013 -
CARE-MI - Cardio repair european multidisciplinary initiative
Evropski projekti(CARE-MI), 01.04.2010 - 31.03.2015 -
PKP 1 - GenExpress
Projekti strukturnih skladov(PKP 1), 01.04.2014 - 30.09.2014 -
Uporaba globokih modelov pri analizi slik na področju sistemske biologije socialne amebe Dictyostelium
Bilaterarni projekti01.01.2017 - 31.12.2018 -
DNA sampling II: Metoda za prepoznavo na DNA neposredno ali posredno vezanih proteinov v bakteriji
Raziskovalni projekti ARRS01.05.2017 - 30.04.2020 -
TURIZEM 4.0 - Obogatene turistične izkušnje
Projekti strukturnih skladov(TURIZEM 4.0), 01.09.2018 - 31.08.2021 -
Vloga paraspeklom podobnih jedrnih telesc pri patogenezi nevrodegenerativnih bolezni ALS in FTD
Raziskovalni projekti ARRS01.07.2018 - 30.06.2021 -
OMANOVIĆ AMRA - AMRA OMANOVIĆ - mlada raziskovalka
Raziskovalni projekti ARRS(OMANOVIĆ AMRA), 01.11.2018 - 31.10.2022 -
J4-1778 - Uporaba malega proteinabakteriofaga v boju proti razvoju odpornosti proti antibiotikom pri bakteriji Staphylococcus aureus
Raziskovalni projekti ARRS(J4-1778), 01.07.2019 - 30.06.2022
Več
