• J1-70022 - SMART-AD-DETECT: Premikanje meja detekcije zgodnje Alzheimerjeve bolezni
Naročnik: ( J1-70022 )
Tip projekta: Raziskovalni projekti ARRS
Trajanje projekta: 2026 - 2029
  • Opis

Alzheimerjeva bolezen je progresivna ireverzibilna nevrodegenerativna bolezen. Izguba spomina in drugi simptomi so povezani s spremembami v

možganih, ki vključujejo plake amiloida beta in nevrofibrilarne pentlje proteina tau. Sedanje diagnostične metode so invazivne in se uporabljajo le za

potrditev diagnoze po pojavu kliničnih simptomov. Cilj tega projekta je razvoj metode, ki bo zgolj z uporabo enostavne in dostopne inštrumentalne

tehnike omogočala detekcijo biomarkerjev (bioloških označevalcev) Alzheimerjeve bolezni v vzorcu plazme. Tehnika bo bazirala na majhni

fluorescenčni molekulski sondi, ki bo po dodatku v krvno plazmo prepoznala biomarkerje. Pri tem bo sonda kazala značilno fluorescenco, ki jo bo

mogoče enostavno izmeriti. Biomarkerji, ki bodo tarča te raziskave, so agregati amiloida beta (Aβ) in proteina tau (Tau), za katere je znano, da so

prisotni v krvi in odražajo patologijo v možganih. Pri načrtovanju te sonde bomo prvi uporabili računalniško podprta orodja, kombinacijo strojnega

učenja, umetne inteligence, molekulskega modeliranja in kvantnomehanske metode, kot je (časovno odvisna) teorija gostotnega funkcionala (TD)-

DFT. V iskanju spojine vodnice bomo sintetiziranim molekulam z in vitro testi preučili selektivnost in vezavno afiniteto do agregatov Aβ in Tau,

pripravljenih v laboratoriju. Študije v kompleksnejšem okolju, bolj podobnem realnemu vzorcu, pa bomo naredili z in cellulo testi. Eden od dokazov

koncepta bo tudi testiranje spojin vodnic ex vivo na post mortem možganskih tkivih bolnikov z Alzheimerjevo boleznijo. Povečanje občutljivosti

metode saj je koncentracija agregatov Aβ in Tau v krvi nizka bomo med drugim dosegli z vezavo spojin vodnic na magnetne nanoskupke, kar bo

omogočilo koncentriranje biomarkerjev v plazmi z magnetom. Dodatno bomo za ojačanje fluorescenčnega in s tem diagnostičnega signala

implementirali tehnologijo z zlatimi nanopalčkami. Kvantitativno analizo krvne plazme s pomočjo razvite fluorescenčne molekulske sonde bomo

naredili z metodo FIDA (»flow-induced dispersion analysis«). Za dosego omenjenih ciljev je v projekt vključenih deset raziskovalnih inštitucij, ki bodo

s svojim raznovrstnim znanjem in izkušnjami pripomogle k realizaciji zadanih nalog. Projektne članice, ki prihajajo iz Slovenije, so i) Univerza v

Ljubljani (UL) Fakulteta za kemijo in kemijsko tehnologijo (vodja dr. Jerneja Kladnik), ii) UL Fakulteta za farmacijo (doc. dr. Damijan Knez), iii) UL

Medicinska fakulteta (prof. dr. Mara Bresjanac), iv) UL Fakulteta za računalništvo in informatiko (doc. dr. Matevž Pesek) in v) Institut »Jožef Stefan«

(doc. dr. Slavko Kralj). Poleg tega pa so v projekt vključene tudi raziskovalne ustanove iz Evrope in ZDA, to so vi) CIC biomaGUNE (dr. Jordi Llop), vii)

David Geffen School of Medicine UCLA (prof. ddr. Jorge R. Barrio), viii) Univerza za tehnologijo in ekonomijo v Budimpešti (izr. prof. dr. Julianna

Oláh), ix) Univerza v Barceloni (prof. dr. Raimon Sabaté) in Univerza v Utrechtu (prof. dr. Stefan Rüdiger).