Naslov doktorske disertacije: Učenje predstavitev in časovno modeliranje velikih, dinamičnih sistemov (Representation Learning and Temporal Modeling of Large-Scale Dynamic Systems)

Povzetek: 

Sodobna znanstveno-raziskovalna dejavnost vse bolj temelji na analizi velikih, visokorazsežnih podatkovnih zbirk. Na številnih področjih so dvorazsežne vložitve postale pomembno orodje za analizo velikih podatkovnih zbirk, saj v podatkih razkrivajo strukturo, pomagajo pri oblikovanju hipotez in podpirajo znanstveno komunikacijo. Njihova praktična uporaba pa predstavlja tudi številne izzive, povezane s skalabilnostjo, ponovno uporabo, interpretacijo in upoštevanjem časovne strukture podatkov.

V disertaciji predstavimo štiri sklope prispevkov. Prvič, razvijemo skalabilno in razširljivo implementacijo openTSNE za gradnjo dvorazsežnih vložitev, ter predstavimo nov pristop za dodajanje novih podatkov v obstoječe vložitve. Drugič, predstavimo nove samodejne pristope za interpretacijo in razlago dvorazsežnih vložitev, med njimi metodo VERA, ki je namenjena splošni uporabi, ter pristop prilagojen domeni medicine. Tretjič, obstoječe metode razširimo tako, da med gradjo vložitev izrecno upoštevamo časovno strukturo podatkov. Četrtič, od raziskovalne vizualizacije preidemo k formalnemu statističnemu modeliranju, pri katerem z uporabo obnovitvenih procesov iz longitudinalnih trajektorij predpisovanja zdravil sklepamo o bolezenskem stanju posameznikov. Razvite pristope ovrednotimo na podatkih elektronskih zdravstvenih zapisov in na podatkih pridobljenih iz celične transkriptomike ter pokažemo da je nizkorazsežne vložitve možno zgraditi na učinkovit način, jih ponovno uporabiti, samodejno razložiti in nadgraditi tako, da bolje odražajo časovno strukturo podatkov, hkrati pa dopolnjujejo eksplicitne statistične modele procesov v ozadju.

Prostor zagovora/Termin zagovora: izvedba predstavitve bo potekala v online okolju, četrtek 14. 5. 2026 ob 10:00.

Komisija za spremljanje doktorske disertacije:

• prof. dr. Marko Robnik Šikonja, predsednik
• prof. dr. Saša Džeroski, član
• prof. dr. Allan Tucker, član

Mentor: prof. dr. Blaž Zupan

Somentorica: izr. prof. dr. Marinka Žitnik

Povezava do video kanala, po katerem se bo prenašal zagovor in ga bo možno spremljati, bo dodana najkasneje na dan zagovora (predvidoma 30 minut pred terminom izvedbe zagovora) na spletni strani: https://ucilnica.fri.uni-lj.si/course/view.php?id=359